18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2905 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  35.75 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  34.24 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  34.24 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  29.65 
 
 		 222 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  29.07 
 
 		 214 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  27.91 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  26.74 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  26.16 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  31.49 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1011  hypothetical protein  27.68 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  29.44 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  31.9 
 
 		 288 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  25.27 
 
 		 435 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0363  hypothetical protein  29.63 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806231  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1735  hypothetical protein  26.71 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>