20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2130 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  43.45 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  36.92 
 
 		 308 aa  85.1  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  29.55 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  36.61 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  28.98 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  27.53 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  28.98 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  27.53 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  29.83 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  31.49 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  34.9 
 
 		 435 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  30.05 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1011  hypothetical protein  33.16 
 
 		 279 aa  72  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  29.38 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  26.97 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0363  hypothetical protein  22.41 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806231  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  26.97 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1922  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1013  hypothetical protein  23.3 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>