43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3504 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  100 
 
 		 1164 aa  2362    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  47.57 
 
 		 714 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1101 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  34.03 
 
 		 1147 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1053  LamG domain-containing protein  29.26 
 
 		 948 aa  247  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1645  LamG domain-containing protein  29.12 
 
 		 958 aa  244  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.143921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  28.75 
 
 		 2038 aa  211  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0562  hypothetical protein  47.75 
 
 		 391 aa  177  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1375 aa  177  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  32.7 
 
 		 2031 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 2046 aa  148  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1279  putative large secreted protein  27.2 
 
 		 1037 aa  145  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97722  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  27.41 
 
 		 2113 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1931 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.79 
 
 		 864 aa  107  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1231  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1209 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  29.06 
 
 		 570 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  34.68 
 
 		 2585 aa  99.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.29 
 
 		 1064 aa  98.6  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0895  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.09 
 
 		 456 aa  97.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3504  LamG domain-containing protein  29.85 
 
 		 508 aa  95.9  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.4 
 
 		 523 aa  81.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  27.75 
 
 		 2318 aa  77.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  23.04 
 
 		 2224 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  23.04 
 
 		 2224 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  23.04 
 
 		 2224 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.47 
 
 		 2225 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  23.58 
 
 		 2246 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  25.98 
 
 		 2447 aa  66.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  23.38 
 
 		 2221 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.14 
 
 		 2178 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1265 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.09 
 
 		 11716 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  28.38 
 
 		 846 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.71 
 
 		 3273 aa  55.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1367 aa  53.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  30.26 
 
 		 6678 aa  53.5  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  24.58 
 
 		 2066 aa  50.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.72 
 
 		 306 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.1 
 
 		 4433 aa  45.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.01 
 
 		 2503 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.47 
 
 		 3699 aa  45.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.23 
 
 		 3699 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>