40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1016 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  100 
 
 		 1265 aa  2588    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  31.13 
 
 		 1735 aa  171  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  30.89 
 
 		 2374 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  33.9 
 
 		 6678 aa  78.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1107  hypothetical protein  28.16 
 
 		 694 aa  77.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  30.83 
 
 		 786 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  29.69 
 
 		 1306 aa  67  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  30.37 
 
 		 1072 aa  65.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.5 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  32.56 
 
 		 1479 aa  58.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.9 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3504  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1164 aa  57.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.65 
 
 		 11716 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1367 aa  56.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  29.32 
 
 		 2223 aa  55.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2229  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.88 
 
 		 273 aa  55.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0720047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1931 aa  54.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  33.1 
 
 		 430 aa  53.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  33.85 
 
 		 1597 aa  52.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.56 
 
 		 4761 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0515  hypothetical protein  24.26 
 
 		 283 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  28.12 
 
 		 471 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  31.36 
 
 		 2066 aa  50.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3470  hypothetical protein  50 
 
 		 2836 aa  50.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0237631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  31.48 
 
 		 643 aa  49.7  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  31.25 
 
 		 1035 aa  50.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  31.16 
 
 		 793 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  29.24 
 
 		 1159 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1107 aa  48.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  24.66 
 
 		 1047 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.65 
 
 		 288 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1101 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  60 
 
 		 1394 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 599 aa  46.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  27.75 
 
 		 339 aa  46.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  29.37 
 
 		 1219 aa  45.8  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  42.37 
 
 		 1188 aa  45.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.76 
 
 		 1298 aa  45.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  48.57 
 
 		 683 aa  45.1  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  48.57 
 
 		 683 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>