17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2229 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2229  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0720047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.49 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  30.82 
 
 		 4761 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  28.67 
 
 		 3907 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1265 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  24.71 
 
 		 643 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  35.06 
 
 		 471 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  24.3 
 
 		 1072 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  36.78 
 
 		 430 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.08 
 
 		 1967 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.85 
 
 		 739 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  33.03 
 
 		 1310 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.62 
 
 		 804 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1367 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.54 
 
 		 3507 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  24.9 
 
 		 1025 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  28.3 
 
 		 739 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>