49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1773 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 
288 aa  563  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2229  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  32.97 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0720047  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  29.15 
 
 
1066 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  32.42 
 
 
3907 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  30.13 
 
 
846 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  27.02 
 
 
1310 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.91 
 
 
1035 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.78 
 
 
11716 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.51 
 
 
757 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  27.73 
 
 
1306 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  29.09 
 
 
739 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  31.58 
 
 
4433 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  29.15 
 
 
4357 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  28.92 
 
 
1067 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  29.86 
 
 
564 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  29.61 
 
 
739 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.22 
 
 
848 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0638  hypothetical protein  27.92 
 
 
250 aa  52.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  24.79 
 
 
1074 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  24.56 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  28.64 
 
 
767 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  25.94 
 
 
1931 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.82 
 
 
1265 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  37.8 
 
 
981 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  25.83 
 
 
643 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  25.11 
 
 
471 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.39 
 
 
804 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.69 
 
 
4761 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  25.86 
 
 
1013 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.57 
 
 
3507 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  27.12 
 
 
1101 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  25.79 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0663  hypothetical protein  26.25 
 
 
250 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.351278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 
585 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  23.31 
 
 
1072 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  30.05 
 
 
1367 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  33.64 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27.7 
 
 
1735 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.15 
 
 
1679 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  31.25 
 
 
1576 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  25.66 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.49 
 
 
1147 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.47 
 
 
3822 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  24.83 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  30.11 
 
 
786 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5765  hypothetical protein  29.9 
 
 
593 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  22.66 
 
 
865 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 
741 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  26.43 
 
 
250 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>