52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2131 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  100 
 
 		 981 aa  1967    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1479  hypothetical protein  34.77 
 
 		 774 aa  385  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.202348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0090  hypothetical protein  31.77 
 
 		 820 aa  352  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1367 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.1 
 
 		 3507 aa  61.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.22 
 
 		 4433 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  29.47 
 
 		 846 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.28 
 
 		 1035 aa  57.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  26.51 
 
 		 1067 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  22.7 
 
 		 824 aa  57  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1931 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.94 
 
 		 236 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.46 
 
 		 6678 aa  55.5  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4088  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.53 
 
 		 754 aa  55.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  35.14 
 
 		 1009 aa  54.7  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1260 aa  54.7  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  27.81 
 
 		 4357 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  27.91 
 
 		 1565 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  24.68 
 
 		 252 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  23.38 
 
 		 316 aa  52.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.15 
 
 		 265 aa  52.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  28.78 
 
 		 864 aa  52.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  39.74 
 
 		 288 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.1 
 
 		 757 aa  51.2  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  34.78 
 
 		 2223 aa  51.2  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  24.67 
 
 		 1013 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  29.37 
 
 		 767 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.06 
 
 		 1424 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5754  LamG-like jellyroll fold  25.57 
 
 		 741 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6119  LamG domain-containing protein  25.57 
 
 		 741 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.86 
 
 		 1064 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  22.75 
 
 		 2334 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  29.08 
 
 		 1310 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.16 
 
 		 4761 aa  49.7  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  29.06 
 
 		 1150 aa  49.3  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  27.45 
 
 		 564 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6601  LamG domain-containing protein  27.86 
 
 		 741 aa  48.5  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.74 
 
 		 11716 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4454  hypothetical protein  25.45 
 
 		 280 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000148618  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  31.51 
 
 		 570 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.82 
 
 		 585 aa  47.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.95 
 
 		 1147 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  27.65 
 
 		 3861 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.92 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.14 
 
 		 603 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4268  hypothetical protein  24.88 
 
 		 313 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.963406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  38.75 
 
 		 1292 aa  46.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  25.57 
 
 		 1306 aa  46.2  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  27.45 
 
 		 739 aa  45.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.82 
 
 		 3822 aa  45.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.85 
 
 		 848 aa  44.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1576 aa  44.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>