57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0378 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  41.89 
 
 		 1066 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 		 1067 aa  2193    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1074 aa  798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  39.67 
 
 		 1091 aa  757    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  39.02 
 
 		 1068 aa  737    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  39.51 
 
 		 1074 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  35.88 
 
 		 1063 aa  607  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  37.5 
 
 		 1182 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  50.73 
 
 		 1046 aa  349  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  44.53 
 
 		 772 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  45.71 
 
 		 765 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  46.13 
 
 		 776 aa  332  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  47.06 
 
 		 888 aa  314  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  44.93 
 
 		 1171 aa  293  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  44.51 
 
 		 1013 aa  286  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  43.59 
 
 		 924 aa  281  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  45.4 
 
 		 917 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  43.8 
 
 		 922 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  35.93 
 
 		 911 aa  255  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  29.91 
 
 		 963 aa  196  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  30.98 
 
 		 883 aa  195  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  32.64 
 
 		 1129 aa  190  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  33.24 
 
 		 1097 aa  189  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  39.47 
 
 		 792 aa  189  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  31.47 
 
 		 984 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  32.32 
 
 		 922 aa  176  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  35.71 
 
 		 782 aa  175  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  29.38 
 
 		 805 aa  165  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  26.24 
 
 		 841 aa  94  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  27.75 
 
 		 1737 aa  87.8  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  28.19 
 
 		 725 aa  80.9  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  54.55 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  25.7 
 
 		 626 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  24.71 
 
 		 768 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  25.36 
 
 		 759 aa  71.2  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  23.65 
 
 		 785 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  25.48 
 
 		 833 aa  70.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  26.11 
 
 		 893 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  26.79 
 
 		 1178 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  22.48 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  30.43 
 
 		 147 aa  62  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  26.85 
 
 		 1174 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  28.97 
 
 		 981 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  31.82 
 
 		 492 aa  52  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  31.82 
 
 		 493 aa  51.6  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.98 
 
 		 288 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  23.08 
 
 		 2334 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  27.19 
 
 		 582 aa  49.7  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  27.19 
 
 		 587 aa  49.3  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.67 
 
 		 1310 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  31.37 
 
 		 468 aa  46.6  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  23.56 
 
 		 4433 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  36.47 
 
 		 562 aa  45.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  30.84 
 
 		 131 aa  45.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  22.35 
 
 		 646 aa  44.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  31.11 
 
 		 466 aa  44.7  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 804 aa  44.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>