61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1890 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
922 aa  1900    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  33.69 
 
 
1129 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  33.55 
 
 
883 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  44.27 
 
 
984 aa  324  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  42.37 
 
 
1097 aa  300  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  41.27 
 
 
805 aa  261  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  39.6 
 
 
963 aa  261  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  35.46 
 
 
1063 aa  220  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  35.64 
 
 
1046 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  34.04 
 
 
1091 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  34.11 
 
 
772 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  34.44 
 
 
1074 aa  211  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  34.54 
 
 
765 aa  210  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  32.1 
 
 
924 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  34.16 
 
 
1171 aa  210  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  33.6 
 
 
1066 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  33.16 
 
 
776 aa  207  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  35 
 
 
1013 aa  206  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  33.42 
 
 
1182 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  42.06 
 
 
792 aa  202  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  32.1 
 
 
1068 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  31.42 
 
 
911 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  31.2 
 
 
922 aa  197  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  30.99 
 
 
917 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  42.86 
 
 
782 aa  188  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  32.24 
 
 
1074 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  32.32 
 
 
1067 aa  176  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  31.51 
 
 
888 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  28.81 
 
 
768 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  27.35 
 
 
785 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.4 
 
 
841 aa  111  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  24 
 
 
759 aa  94  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  24.88 
 
 
725 aa  87.8  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.58 
 
 
1737 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  42 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  29.63 
 
 
1178 aa  77.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  34.33 
 
 
833 aa  74.7  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  39.81 
 
 
646 aa  73.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  35.71 
 
 
893 aa  70.5  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  29.93 
 
 
626 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  32.11 
 
 
998 aa  68.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  33.57 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  35.56 
 
 
651 aa  64.7  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  24.46 
 
 
562 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  38.2 
 
 
724 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  36.67 
 
 
465 aa  57  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  37.78 
 
 
503 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 
756 aa  55.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  33.98 
 
 
136 aa  55.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  31.96 
 
 
468 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  31.07 
 
 
132 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  25.97 
 
 
729 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  30.59 
 
 
124 aa  52  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32.99 
 
 
507 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  30.1 
 
 
132 aa  48.9  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0348  hypothetical protein  32.22 
 
 
131 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  31.52 
 
 
129 aa  48.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  34.09 
 
 
189 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  30.11 
 
 
716 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5681  hypothetical protein  27.27 
 
 
223 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  46.2  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>