58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3816 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
984 aa  2021    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  30.98 
 
 
963 aa  415  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  44.27 
 
 
922 aa  325  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  40.43 
 
 
1097 aa  293  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  39.57 
 
 
1129 aa  285  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  35.27 
 
 
883 aa  277  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  32.97 
 
 
805 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  35.7 
 
 
1046 aa  213  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  33.77 
 
 
1068 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  32.15 
 
 
1063 aa  205  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  33.8 
 
 
1013 aa  204  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  32.48 
 
 
1182 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  37.83 
 
 
792 aa  202  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  31 
 
 
1074 aa  197  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  32.18 
 
 
772 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  32.03 
 
 
1091 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  41.56 
 
 
782 aa  190  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  32.17 
 
 
1066 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  30.63 
 
 
1074 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  32.44 
 
 
924 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  34.71 
 
 
1171 aa  184  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  31.47 
 
 
1067 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  28.88 
 
 
922 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  31.97 
 
 
911 aa  178  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  30.19 
 
 
765 aa  177  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  31.25 
 
 
776 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  29.97 
 
 
917 aa  173  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  31.27 
 
 
888 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  29.25 
 
 
785 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  28.95 
 
 
768 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.95 
 
 
841 aa  119  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  28.16 
 
 
833 aa  99.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  39.71 
 
 
706 aa  99  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  27.31 
 
 
759 aa  91.3  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  27.88 
 
 
1737 aa  87.8  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  26.79 
 
 
893 aa  82  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  26.5 
 
 
1178 aa  80.1  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  33.8 
 
 
147 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  22.3 
 
 
626 aa  72.8  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  27.09 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  27.33 
 
 
725 aa  69.7  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.68 
 
 
717 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  26.18 
 
 
562 aa  66.6  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  24.88 
 
 
998 aa  65.1  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  39.33 
 
 
651 aa  65.1  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  38.14 
 
 
724 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  34.02 
 
 
503 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  28.97 
 
 
716 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7871  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.33 
 
 
508 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  34.91 
 
 
468 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  33.33 
 
 
729 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.33 
 
 
507 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  34.04 
 
 
646 aa  48.9  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  34.95 
 
 
136 aa  48.5  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  33.63 
 
 
465 aa  48.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  26.83 
 
 
756 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  28.36 
 
 
676 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  29.36 
 
 
132 aa  46.2  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>