51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0299 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  40.83 
 
 		 841 aa  92.8  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  40 
 
 		 1097 aa  90.1  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  42.55 
 
 		 963 aa  84  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  38.38 
 
 		 1129 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  42 
 
 		 922 aa  81.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  33.8 
 
 		 984 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  35.58 
 
 		 1013 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  37.25 
 
 		 883 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  39.36 
 
 		 651 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  32.98 
 
 		 785 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  33.63 
 
 		 1046 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  33.7 
 
 		 768 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  37.25 
 
 		 646 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  28.79 
 
 		 805 aa  65.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  32.67 
 
 		 911 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  31.5 
 
 		 1063 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  33.96 
 
 		 724 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  32.23 
 
 		 729 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  31.78 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  33.96 
 
 		 503 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  29.85 
 
 		 1182 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  30.43 
 
 		 1067 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.37 
 
 		 507 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  32.76 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  30.77 
 
 		 924 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.98 
 
 		 756 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  32.38 
 
 		 1171 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  28.83 
 
 		 776 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  31.96 
 
 		 922 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  29.13 
 
 		 772 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  30.11 
 
 		 917 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  30.1 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  35.45 
 
 		 765 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  35.44 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  29.01 
 
 		 1074 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  34.62 
 
 		 465 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  28.7 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  33.01 
 
 		 1066 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  31.07 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  32.67 
 
 		 1737 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  31.07 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  30.85 
 
 		 1068 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  32.79 
 
 		 888 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  31.13 
 
 		 1091 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  34.07 
 
 		 299 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1074 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  24.53 
 
 		 716 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0161  hypothetical protein  27.88 
 
 		 171 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  27.13 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>