38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3541 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0974  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0920  hypothetical protein  38.06 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  38.32 
 
 		 484 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0971  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0962  hypothetical protein  40.74 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0161  hypothetical protein  35.19 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  30.77 
 
 		 917 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  28.15 
 
 		 1737 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 465 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  32.33 
 
 		 841 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  34.95 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  34.29 
 
 		 646 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 		 922 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  28.37 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  29.41 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0249  hypothetical protein  34.58 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  decreased coverage  0.00118438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  30.84 
 
 		 1013 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  25.93 
 
 		 911 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  36.21 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2733  esterified fatty acid cis/trans isomerase  39.58 
 
 		 770 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135603  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0348  hypothetical protein  27.94 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2852  hypothetical protein  42.31 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1216  hypothetical protein  42.31 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 		 756 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.07 
 
 		 1129 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  27.12 
 
 		 503 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  32.35 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0436  hypothetical protein  42.86 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4271  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1767  hypothetical protein  42.86 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1582  hypothetical protein  42.86 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841071  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  29.82 
 
 		 468 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  25.89 
 
 		 924 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  30.48 
 
 		 251 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  29.06 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  27.13 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  28.78 
 
 		 1063 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  30.83 
 
 		 1097 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>