62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1976 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  100 
 
 		 724 aa  1483    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  57.89 
 
 		 729 aa  888    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  39.32 
 
 		 716 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  35.17 
 
 		 507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  33.86 
 
 		 468 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  29.96 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  30.98 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  31.72 
 
 		 785 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  31.15 
 
 		 768 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  36.11 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  40.95 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  36.54 
 
 		 1737 aa  70.9  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  35.14 
 
 		 776 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.98 
 
 		 756 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  36.08 
 
 		 841 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  29.32 
 
 		 1129 aa  65.1  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  34.19 
 
 		 1097 aa  64.7  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  33.96 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  29.94 
 
 		 1091 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  37.27 
 
 		 1182 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  29.59 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  31.97 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  35.05 
 
 		 1013 aa  62  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  38.14 
 
 		 984 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  38.2 
 
 		 922 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  29.71 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1444  hypothetical protein  23.47 
 
 		 807 aa  58.2  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.239906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  33.91 
 
 		 1066 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  29.09 
 
 		 1063 aa  57.4  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  32.99 
 
 		 124 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  30.89 
 
 		 917 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1712  hypothetical protein  23.47 
 
 		 807 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0116958  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.34 
 
 		 779 aa  55.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  30.56 
 
 		 911 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  29.52 
 
 		 132 aa  54.7  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.23 
 
 		 775 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  29.17 
 
 		 922 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 		 1046 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  28.7 
 
 		 136 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  32.43 
 
 		 131 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  32.38 
 
 		 765 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  34.31 
 
 		 1068 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  34.07 
 
 		 883 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  27.84 
 
 		 651 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  29.03 
 
 		 963 aa  50.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  37.08 
 
 		 474 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.82 
 
 		 795 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  28 
 
 		 175 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.53 
 
 		 481 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.46 
 
 		 762 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  25 
 
 		 976 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  28.77 
 
 		 189 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  30.28 
 
 		 924 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  28.24 
 
 		 1074 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  27.89 
 
 		 344 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  29.29 
 
 		 129 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1756 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1074 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  44.29 
 
 		 1085 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  28.83 
 
 		 1171 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 652 aa  45.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>