14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5046 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  36.84 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  33 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  41.3 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  36.67 
 
 		 696 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  31.63 
 
 		 729 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  34 
 
 		 465 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  31.07 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  28.77 
 
 		 724 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  34.09 
 
 		 922 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  33.7 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  30 
 
 		 765 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  29.51 
 
 		 776 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>