21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1712 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 807 aa  1649    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0116958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1444  hypothetical protein  97.27 
 
 		 807 aa  1604    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.239906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.95 
 
 		 779 aa  94.7  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.23 
 
 		 775 aa  94.4  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  30.4 
 
 		 976 aa  90.5  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.57 
 
 		 762 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.14 
 
 		 795 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  27.83 
 
 		 716 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.77 
 
 		 774 aa  75.1  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2251  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.1 
 
 		 752 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  23.47 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.17 
 
 		 772 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  23.24 
 
 		 729 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  43.1 
 
 		 652 aa  54.3  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 848 aa  50.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 		 551 aa  48.5  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  44.19 
 
 		 14944 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  24.73 
 
 		 795 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.47 
 
 		 639 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  35.48 
 
 		 569 aa  44.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.23 
 
 		 790 aa  44.3  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>