38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0141 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  27 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  27.35 
 
 		 724 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  25.9 
 
 		 468 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  25.09 
 
 		 785 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  31.37 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  24.51 
 
 		 768 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  38.55 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  32.58 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.96 
 
 		 756 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  34.26 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  25.88 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.45 
 
 		 1737 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  34.95 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  35.44 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  33.65 
 
 		 132 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  23.66 
 
 		 507 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  35.44 
 
 		 805 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  34.21 
 
 		 1066 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  39.13 
 
 		 1182 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  35.24 
 
 		 765 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  40 
 
 		 1068 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  29.9 
 
 		 924 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  32.18 
 
 		 1129 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  33.72 
 
 		 646 aa  45.4  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  32.84 
 
 		 772 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  31.11 
 
 		 911 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  27.01 
 
 		 716 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  25.74 
 
 		 397 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0081  hypothetical protein  27.74 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  27.27 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  30.71 
 
 		 1074 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  30.48 
 
 		 137 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  30.77 
 
 		 236 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>