30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3227 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  53.25 
 
 		 76 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  52.17 
 
 		 317 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  50.72 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  51.32 
 
 		 77 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  45.78 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  45.95 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  45.33 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  42.47 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  40.74 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  42.67 
 
 		 77 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  41.33 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  40.58 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  49.25 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  40.58 
 
 		 79 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  42.86 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  41.67 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  40 
 
 		 77 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  35.79 
 
 		 404 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  31.16 
 
 		 143 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2830  hypothetical protein  29.5 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000108966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1146  hypothetical protein  28.12 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0103  hypothetical protein  29.46 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0912  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.680644 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1157  hypothetical protein  27.56 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  32.89 
 
 		 77 aa  43.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  26.52 
 
 		 173 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3522  hypothetical protein  29.27 
 
 		 126 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>