28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1297 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  316  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  51.59 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  67.11 
 
 		 76 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2890  acidic integral membrane protein  53.26 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  48.68 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2543  acidic integral membrane protein  41.46 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.819668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2889  acidic integral membrane protein  49.38 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.942598  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  45.33 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  49.32 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  50 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  46.58 
 
 		 308 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  48.61 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  43.84 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  44.59 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  41.89 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  43.84 
 
 		 317 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  36 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  41.1 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  36.25 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  33.77 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  38.96 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  41.03 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3226  hypothetical protein  41.27 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0283497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  39.73 
 
 		 303 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2560  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  64.52 
 
 		 277 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403904  normal  0.205693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1558  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  64.52 
 
 		 277 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.455674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  33.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>