26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0899 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  100 
 
 
78 aa  163  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  55.7 
 
 
80 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  53.33 
 
 
77 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  48.72 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  46.05 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  44.59 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  49.32 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  40.85 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  43.06 
 
 
303 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  43.24 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  39.19 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  43.24 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  44.59 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  49.25 
 
 
236 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1872  cytochrome b5  39.24 
 
 
72 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  35.62 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  36.49 
 
 
404 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  35.21 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  35.14 
 
 
303 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  36.99 
 
 
308 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  38.36 
 
 
317 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  44 
 
 
292 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  39.13 
 
 
308 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59858  predicted protein  39.62 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.382382 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04480  sterol metabolism-related protein, putative  40 
 
 
211 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04939  DNA damage response protein (Dap1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10490)  42 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>