21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3563 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  100 
 
 		 78 aa  167  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  74.32 
 
 		 77 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  72 
 
 		 82 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  71.62 
 
 		 79 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  47.37 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  44.74 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  44.59 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  40.74 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  43.66 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  39.47 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  47.46 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  47.46 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  35.62 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  37.84 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  33.78 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  31.51 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59858  predicted protein  42.86 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.382382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  37.31 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  37.74 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04480  sterol metabolism-related protein, putative  35.71 
 
 		 211 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>