26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1196 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  51.59 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  70.13 
 
 		 76 aa  110  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  50 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  49.35 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  46.75 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  44.44 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  39.47 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  47.3 
 
 		 308 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  46.67 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  41.33 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  32.59 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  44.59 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  34.57 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  44 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  38.89 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  41.89 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 404 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  41.67 
 
 		 292 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  39.19 
 
 		 303 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2889  acidic integral membrane protein  44.78 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.942598  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2890  acidic integral membrane protein  45.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2543  acidic integral membrane protein  48.48 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.819668 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01220  sterol metabolism-related protein, putative  31.43 
 
 		 303 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.377134  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04480  sterol metabolism-related protein, putative  33.9 
 
 		 211 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59858  predicted protein  37.14 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.382382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>