19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04480 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA04480  sterol metabolism-related protein, putative  100 
 
 
211 aa  440  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00954  heme/steroid binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16510)  33.96 
 
 
249 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.562561 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61331  predicted protein  43.52 
 
 
194 aa  92  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.972483 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04939  DNA damage response protein (Dap1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10490)  39.81 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40162  predicted protein  30.77 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000257065  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01220  sterol metabolism-related protein, putative  38.64 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.377134  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04329  progesterone binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06240)  41 
 
 
125 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00163821  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38393  predicted protein  38.61 
 
 
110 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870833  normal  0.425378 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50959  predicted protein  35.58 
 
 
118 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36937 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29865  predicted protein  36.36 
 
 
118 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02710  sterol metabolism-related protein, putative  35.29 
 
 
167 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49495  predicted protein  28.97 
 
 
288 aa  55.1  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59858  predicted protein  45.1 
 
 
154 aa  51.6  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.382382 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_8141  predicted protein  47.73 
 
 
63 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  34.92 
 
 
404 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  33.9 
 
 
149 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  36.36 
 
 
292 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  35.71 
 
 
78 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  33.9 
 
 
132 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>