24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0254 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  89.91 
 
 		 317 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  61.17 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  67.13 
 
 		 303 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  50.72 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  43.84 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  44 
 
 		 77 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  38.1 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  45.21 
 
 		 81 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  45.59 
 
 		 82 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  41.1 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  44.29 
 
 		 80 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  39.44 
 
 		 77 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  47.46 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  40.85 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  41.43 
 
 		 79 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  41.89 
 
 		 132 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  28.35 
 
 		 160 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  30.69 
 
 		 149 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  31.34 
 
 		 551 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  39.13 
 
 		 78 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  32.94 
 
 		 404 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  33.8 
 
 		 77 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>