24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1594 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  100 
 
 		 80 aa  164  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  62.16 
 
 		 77 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  58.44 
 
 		 81 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  55.7 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  43.42 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  48 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  46.75 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  46.75 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  44.59 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  42.47 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  34.67 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  36 
 
 		 404 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  46.58 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1872  cytochrome b5  39.24 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  41.89 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  43.84 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  41.1 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  43.84 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  43.84 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  42.47 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  44.29 
 
 		 308 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  41.67 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59858  predicted protein  42.59 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.382382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>