23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1871 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  100 
 
 		 81 aa  169  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  68 
 
 		 77 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  58.44 
 
 		 80 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  48.72 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  49.33 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  44 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  48.61 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  45.21 
 
 		 308 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  44.74 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  41.67 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  41.67 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1872  cytochrome b5  44.16 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 303 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  43.24 
 
 		 303 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  42.47 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  43.84 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  41.33 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  41.33 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  38.67 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  42.86 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  44 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  37.84 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>