23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2659 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  100 
 
 
303 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  67.13 
 
 
308 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  65.44 
 
 
317 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  61.74 
 
 
308 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  46.67 
 
 
77 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  45.95 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  41.1 
 
 
76 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  43.66 
 
 
78 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  43.84 
 
 
79 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  43.06 
 
 
78 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  43.24 
 
 
81 aa  60.8  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  40 
 
 
82 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  39.73 
 
 
77 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  43.84 
 
 
80 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  35.14 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  34.18 
 
 
404 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  34.04 
 
 
149 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  39.73 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  39.19 
 
 
132 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  30.17 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  35.62 
 
 
77 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  35.44 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>