21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2822 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  100 
 
 
404 aa  814    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  81.25 
 
 
303 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  43.04 
 
 
149 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  36 
 
 
80 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  40 
 
 
77 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  35.53 
 
 
81 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  25.76 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  34.18 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  38.96 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  36.49 
 
 
78 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  34.21 
 
 
77 aa  53.1  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  39.47 
 
 
132 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  35.79 
 
 
236 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  36.9 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  36.76 
 
 
77 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  30.83 
 
 
600 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04480  sterol metabolism-related protein, putative  34.92 
 
 
211 aa  47  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1872  cytochrome b5  32.43 
 
 
72 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  33.33 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  32.94 
 
 
308 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>