19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0165 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  100 
 
 
77 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  43.42 
 
 
80 aa  78.2  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  46.05 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  42.67 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  44 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  37.33 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1872  cytochrome b5  35.53 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  34.21 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  36.76 
 
 
404 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  29.73 
 
 
303 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  35.62 
 
 
303 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  32.89 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  33.33 
 
 
308 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  33.78 
 
 
317 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  33.8 
 
 
308 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  34.62 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  30.99 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  28.95 
 
 
77 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.73255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>