16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2508 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  81.25 
 
 		 404 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  34.67 
 
 		 80 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  34.21 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  31.94 
 
 		 77 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  36.11 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  25.34 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  35.14 
 
 		 78 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  29.73 
 
 		 77 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  35.8 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  35.44 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  30.3 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  29.82 
 
 		 600 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1872  cytochrome b5  28.38 
 
 		 72 aa  42.7  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>