23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0201 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  63.67 
 
 		 308 aa  384  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  61.59 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2659  cytochrome b5  61.74 
 
 		 303 aa  333  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  45.78 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0260  hypothetical protein  49.32 
 
 		 76 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1453  cytochrome b5  46.67 
 
 		 77 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1873  cytochrome b5  43.24 
 
 		 77 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1297  hypothetical protein  46.58 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566226  normal  0.259523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1196  hypothetical protein  47.3 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1594  cytochrome b5  43.84 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1871  cytochrome b5  41.33 
 
 		 81 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1069  cytochrome b5  36.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.586794  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3063  hypothetical protein  37.84 
 
 		 77 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5190  cytochrome b5  40.85 
 
 		 82 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3698  cytochrome b5  40.54 
 
 		 79 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0199547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0625  cytochrome b5  31.03 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  32.23 
 
 		 160 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0899  cytochrome b5  36.99 
 
 		 78 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0201754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2822  heme/steroid binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 404 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3563  cytochrome b5  37.31 
 
 		 78 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.576407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2508  heme/steroid binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0165  cytochrome b5  33.33 
 
 		 77 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>