34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0696 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  26.45 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  28.35 
 
 		 308 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  29.66 
 
 		 317 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0201  cytochrome b5  32.23 
 
 		 308 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  37.8 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  24.18 
 
 		 578 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  36.17 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  33.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  39.44 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  36.84 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  33.68 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  34.41 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  39.44 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  32.32 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  39.44 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  39.44 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  32.32 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  32.32 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  32.04 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  26.92 
 
 		 287 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  35.11 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  32.26 
 
 		 152 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  29.61 
 
 		 290 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.38 
 
 		 927 aa  40.8  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>