84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2617 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  36.96 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  34.85 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  36.51 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  39.66 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  35.53 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  35.53 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  33.88 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  34.54 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  34.11 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  36.51 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  36.99 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  30.39 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  36.44 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  30.16 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.51 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  34.81 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  41.9 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  32.87 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  32.15 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  33.85 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  32.2 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  35 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  29.31 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  28.97 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  28.97 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  28.97 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  28.97 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  34.97 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  32.95 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  28.62 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  30.54 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  30.2 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  30.2 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  28.62 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  28.22 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  30.2 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  27.93 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  27.93 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  28.67 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  29.3 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  28.3 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  28.03 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.03 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  30.86 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  31.75 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  33.11 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  24.56 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  38.93 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30.58 
 
 		 578 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  24.42 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  37.75 
 
 		 539 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  36.55 
 
 		 559 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  26.43 
 
 		 544 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.89 
 
 		 588 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  36.07 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  33.1 
 
 		 552 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 551 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  30.93 
 
 		 547 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 642 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  31.58 
 
 		 544 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  30.23 
 
 		 547 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.36 
 
 		 549 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  31.58 
 
 		 439 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.69 
 
 		 564 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  30.26 
 
 		 549 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  32.62 
 
 		 687 aa  47  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  35.53 
 
 		 528 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  31.58 
 
 		 544 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  31.58 
 
 		 544 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  30.66 
 
 		 400 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  36.64 
 
 		 512 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.58 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  32.16 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  41.94 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28.12 
 
 		 547 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  29.71 
 
 		 559 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  30.53 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.87 
 
 		 565 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 613 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 590 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.14 
 
 		 663 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.79 
 
 		 927 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>