144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1118 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  100 
 
 
663 aa  1335    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  24 
 
 
927 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.86 
 
 
549 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.26 
 
 
613 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  24.41 
 
 
547 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.6 
 
 
544 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.72 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.37 
 
 
544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.37 
 
 
544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  25.95 
 
 
546 aa  120  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  23.93 
 
 
547 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  23.54 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  23.56 
 
 
549 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  26.06 
 
 
590 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  26.63 
 
 
560 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  28 
 
 
564 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  25.61 
 
 
578 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  24.91 
 
 
571 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 
173 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.52 
 
 
439 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  32.57 
 
 
559 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  25.63 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
118 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 
172 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  22.85 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  30.19 
 
 
588 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  24.94 
 
 
697 aa  67.4  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  27.22 
 
 
565 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  34.25 
 
 
577 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  28.38 
 
 
869 aa  64.3  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 
126 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 
126 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  24.12 
 
 
632 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 
126 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4020  copper resistance D  25.4 
 
 
546 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211434  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 
120 aa  61.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  22.98 
 
 
649 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.53 
 
 
309 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.53 
 
 
309 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  36 
 
 
121 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.47 
 
 
173 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
160 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  34.69 
 
 
125 aa  57.4  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 
170 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  29.55 
 
 
309 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  27.62 
 
 
687 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
141 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
141 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 
111 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  35.51 
 
 
125 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  38.64 
 
 
121 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  32 
 
 
322 aa  55.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 
121 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 
121 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  33.93 
 
 
229 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 
121 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  33.93 
 
 
226 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  29.9 
 
 
126 aa  54.3  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  31.03 
 
 
686 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 
121 aa  54.3  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 
196 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  26.26 
 
 
519 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  32 
 
 
126 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  30.61 
 
 
146 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  28.42 
 
 
708 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  29.33 
 
 
223 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 
226 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  34.58 
 
 
127 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 
124 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
265 aa  52  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  28.57 
 
 
309 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  31.76 
 
 
319 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 
124 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  37.61 
 
 
722 aa  52  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  28.87 
 
 
139 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  28.33 
 
 
207 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  27.84 
 
 
131 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  29.02 
 
 
308 aa  51.2  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  26.43 
 
 
605 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
119 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  30.91 
 
 
708 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  35.87 
 
 
607 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  30.93 
 
 
197 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  27.32 
 
 
309 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  26.2 
 
 
316 aa  50.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  26.47 
 
 
552 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  27.19 
 
 
143 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 
124 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  27.19 
 
 
122 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  31.63 
 
 
133 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 
124 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 
124 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  28.12 
 
 
309 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  26.98 
 
 
290 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1603  copper resistance protein CopC  31.11 
 
 
145 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  26.81 
 
 
290 aa  49.3  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  27.44 
 
 
290 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  28.11 
 
 
290 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  30.93 
 
 
130 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  33.96 
 
 
165 aa  48.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>