80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0498 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  54.52 
 
 		 302 aa  239  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  51.55 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  39.59 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  34.38 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  28.12 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  28.06 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.95 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  33.92 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  35.14 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  41.73 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  31.69 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  35.53 
 
 		 528 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  35.45 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  35.82 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  39.46 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  28.42 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  34.11 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.56 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  29.61 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  29.61 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  29.61 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  29.61 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  29.61 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  35.25 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 		 560 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  30.24 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  31 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  28.7 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  30.43 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  30.13 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  30.13 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  31 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  30.57 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  30.57 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  30.57 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  32.64 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.51 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  31.61 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.21 
 
 		 564 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.99 
 
 		 565 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  29.87 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  32.69 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 613 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  32.43 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  29.22 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.26 
 
 		 731 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  34.62 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  34.62 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  29.17 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 590 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  29.17 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  29.17 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  33.88 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  31.15 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  31.15 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  23.63 
 
 		 547 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.65 
 
 		 544 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  27.31 
 
 		 552 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  29.87 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.65 
 
 		 544 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  41.07 
 
 		 593 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  23.71 
 
 		 547 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  35.56 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  23.65 
 
 		 544 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 588 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  33.65 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  23.65 
 
 		 544 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  32.68 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  32.68 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  30.04 
 
 		 621 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  32.65 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  30.77 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  30.72 
 
 		 551 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  28.99 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  27.86 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 513 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>