38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5053 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  100 
 
 		 309 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  98.06 
 
 		 309 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  55.23 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  54.55 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  39.74 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  35.74 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  32.95 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  30.55 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  34.48 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  36 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  37.14 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  41.3 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  30.08 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1741  copper resistance D  37.4 
 
 		 550 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  37.41 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  37.33 
 
 		 664 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  37.59 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 551 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  35.48 
 
 		 559 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  34.75 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40.43 
 
 		 588 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  32.99 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  31.52 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  48.33 
 
 		 676 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 722 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  35.9 
 
 		 678 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  28.95 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  35.92 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 613 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  28.22 
 
 		 687 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  35.65 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  34.38 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  35.14 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  31.37 
 
 		 559 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  37.25 
 
 		 692 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  41.98 
 
 		 607 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  38.24 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>