233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2426 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  100 
 
 		 539 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  49.03 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  50.3 
 
 		 528 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  51.48 
 
 		 512 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  39.43 
 
 		 576 aa  253  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  41.18 
 
 		 513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  28.63 
 
 		 578 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  27.76 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  29.22 
 
 		 559 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.22 
 
 		 565 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 649 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.1 
 
 		 590 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  27.37 
 
 		 613 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  41.5 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.6 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  42.45 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  34.94 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  23.86 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  39.02 
 
 		 170 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.8 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  43 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  25 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.11 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  42 
 
 		 226 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  25.99 
 
 		 663 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  34.65 
 
 		 173 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.33 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  44 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.33 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  37.88 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  23.1 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  32.26 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.36 
 
 		 731 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  37.5 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  34.69 
 
 		 692 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 244 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 869 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 197 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  24 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  35.16 
 
 		 127 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  34.15 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  26.74 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.62 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  27.34 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  30.42 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.9 
 
 		 675 aa  60.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  27.84 
 
 		 718 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  37.5 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 		 128 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  40.59 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.71 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  37.32 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  37.58 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  26.37 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  26.37 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 		 193 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  33.86 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  34.21 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.33 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  34.29 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  34.09 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  36.43 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  30.06 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  39.36 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  34.54 
 
 		 310 aa  57  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 128 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 128 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 128 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  34.23 
 
 		 119 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  31.4 
 
 		 593 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.21 
 
 		 547 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 126 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  33.33 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  34.41 
 
 		 605 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 128 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  34.82 
 
 		 125 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 128 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  33.93 
 
 		 178 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.65 
 
 		 226 aa  54.3  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  30.63 
 
 		 686 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>