58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1944 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  59.52 
 
 		 294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  59.18 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  58.84 
 
 		 294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  45.17 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  41.78 
 
 		 291 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  41.78 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  41.78 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  41.44 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  41.78 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  39.86 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  39.18 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  39.18 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  39.52 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  38.83 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  39.18 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  41.24 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  38.83 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  38.49 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  38.49 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  43.18 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  34.58 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.95 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  34.87 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  32.57 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  35.66 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  30.28 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  30.54 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  34.8 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  31.79 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  33.09 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  30.69 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  33.98 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  36.72 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  30.62 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  39.61 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  35.36 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  36.55 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  36.55 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  37.24 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  33.7 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  26.04 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  35.18 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  35.29 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  29.95 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  27.74 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  35.38 
 
 		 697 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  37.25 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  30.77 
 
 		 687 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  31.14 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  29.91 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  22.63 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  32.3 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.96 
 
 		 927 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  25.28 
 
 		 343 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.77 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  29.73 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  44.64 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>