123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4446 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 697 aa  1360    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  57.78 
 
 		 718 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  57.16 
 
 		 718 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  49.85 
 
 		 752 aa  595  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  47.59 
 
 		 722 aa  508  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  43.47 
 
 		 687 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  43.55 
 
 		 708 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  52.89 
 
 		 671 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  45.6 
 
 		 683 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  42.4 
 
 		 708 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  40.4 
 
 		 631 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  38.55 
 
 		 739 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  40.2 
 
 		 711 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  39.68 
 
 		 678 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  37.76 
 
 		 651 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  38.29 
 
 		 687 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.44 
 
 		 675 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  38.89 
 
 		 692 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  38.15 
 
 		 681 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  38.25 
 
 		 664 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  36.88 
 
 		 691 aa  356  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  38.68 
 
 		 736 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  38.58 
 
 		 719 aa  353  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  42.95 
 
 		 653 aa  350  5e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.52 
 
 		 686 aa  346  8.999999999999999e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  37.03 
 
 		 665 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  36.88 
 
 		 665 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  36.88 
 
 		 665 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  43.37 
 
 		 651 aa  339  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.25 
 
 		 731 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  43.57 
 
 		 679 aa  334  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  35.8 
 
 		 671 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  36.22 
 
 		 676 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  35.94 
 
 		 672 aa  280  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.3 
 
 		 632 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  42.32 
 
 		 661 aa  249  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  31.32 
 
 		 642 aa  241  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  31.67 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  32.04 
 
 		 637 aa  229  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  32.68 
 
 		 641 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  32.68 
 
 		 641 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.58 
 
 		 319 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  38.11 
 
 		 310 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  41.91 
 
 		 322 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  38.97 
 
 		 322 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  42.86 
 
 		 319 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.75 
 
 		 654 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  34.31 
 
 		 651 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.74 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  35.03 
 
 		 326 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  34.69 
 
 		 331 aa  146  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  34.13 
 
 		 331 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  34.13 
 
 		 331 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  34.03 
 
 		 308 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  33.83 
 
 		 322 aa  137  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.12 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.63 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  30.46 
 
 		 327 aa  109  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.48 
 
 		 394 aa  103  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  30.57 
 
 		 354 aa  99  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  29.21 
 
 		 387 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.83 
 
 		 326 aa  90.9  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  27.09 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  31.44 
 
 		 273 aa  80.5  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  25.31 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  25.73 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  25.31 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  33.89 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  33.09 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  25.31 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  25.62 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  31.93 
 
 		 274 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  33.2 
 
 		 339 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  29.53 
 
 		 315 aa  69.7  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  34.82 
 
 		 294 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  30.56 
 
 		 328 aa  53.9  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  24.44 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  28.09 
 
 		 267 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.38 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  24.44 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.97 
 
 		 265 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.5 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  26.24 
 
 		 270 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  34.82 
 
 		 294 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  34.82 
 
 		 294 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.56 
 
 		 289 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.98 
 
 		 264 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  35.38 
 
 		 293 aa  52  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  24.86 
 
 		 290 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  24.44 
 
 		 290 aa  50.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  23.89 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  23.89 
 
 		 290 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  24.29 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.19 
 
 		 246 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  23.89 
 
 		 290 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  26.25 
 
 		 294 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  30.3 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.22 
 
 		 307 aa  49.7  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>