58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00389 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  100 
 
 		 295 aa  590  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  34.65 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  33.99 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  33.56 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  33.56 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  33.99 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  30.49 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  31.42 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  36.14 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.18 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  34.38 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  24.56 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  29 
 
 		 528 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  24.9 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  24.04 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  25.17 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  28.17 
 
 		 559 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  35.92 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  28.16 
 
 		 551 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  26.63 
 
 		 571 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  26.85 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  26.94 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  26.94 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  28.68 
 
 		 692 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  30.5 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  24.57 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  28.24 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  28.24 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  27.62 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  25.1 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  24.14 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  24.14 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  23.08 
 
 		 621 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  25.1 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  29.66 
 
 		 513 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  25.1 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  25.87 
 
 		 291 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  25.37 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  25.37 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  24.69 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.19 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  33.33 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  29.41 
 
 		 576 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  29.2 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  29.03 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  22.89 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  26.56 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  22.89 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  24.73 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  25.37 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  31.47 
 
 		 539 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  29.46 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  27.69 
 
 		 607 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  27.85 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  29.03 
 
 		 588 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  27.41 
 
 		 578 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  23.97 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.67 
 
 		 927 aa  42.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>