22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0807 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  100 
 
 		 559 aa  1118    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1741  copper resistance D  39.96 
 
 		 550 aa  294  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4020  copper resistance D  30.06 
 
 		 546 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.87 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  28.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  36.55 
 
 		 290 aa  50.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.43 
 
 		 544 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.18 
 
 		 549 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.19 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  37.14 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  23.13 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.13 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  24.18 
 
 		 544 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.56 
 
 		 613 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.18 
 
 		 544 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  23.13 
 
 		 547 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.18 
 
 		 544 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  30.26 
 
 		 651 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  26.11 
 
 		 316 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 		 588 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 564 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>