96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3474 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  621  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  44.62 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  44.27 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  34.38 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  28.62 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  28.8 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  28.62 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  28.62 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  28.3 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  28.8 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  28.62 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  28.62 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  28.3 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  33.96 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  27.42 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  27.1 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  27.1 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  28.94 
 
 		 290 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  31.15 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  27.42 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  33.2 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.39 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  27.42 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.39 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  30.23 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  31.17 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  30.13 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  30.65 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  30.38 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  29.38 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  28.66 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  30.03 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  33.23 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  29.61 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.16 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  28.16 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  27.53 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.75 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  27.8 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  29.61 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  29.84 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  30.53 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  33.71 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  30.41 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  32.75 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  27.55 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  27.55 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.58 
 
 		 927 aa  63.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  29.68 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.92 
 
 		 578 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 564 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  29.43 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  29.43 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.5 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  31.53 
 
 		 718 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  30.58 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  34.96 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  24.55 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  31.97 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  29.32 
 
 		 621 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  30.12 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  23.55 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  25 
 
 		 649 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  31.33 
 
 		 400 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 551 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  27.17 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  32.26 
 
 		 560 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  24.6 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  32.67 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  27.42 
 
 		 613 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  29.39 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  30.5 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  27.24 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  27.24 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  28.98 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1602  copper resistance D domain-containing protein  50.72 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  29.56 
 
 		 869 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  25.84 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  27.27 
 
 		 165 aa  46.6  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  25.84 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  25.79 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  25.78 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  28.51 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  29.94 
 
 		 653 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  26.83 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  28.36 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  25.31 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  26.11 
 
 		 559 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  29.95 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  35.16 
 
 		 549 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  28.03 
 
 		 663 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.23 
 
 		 588 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  39.19 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  39.19 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  34.26 
 
 		 722 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  31.68 
 
 		 547 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>