42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2513 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1205    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  35.68 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  31.87 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  28.97 
 
 		 393 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  30.47 
 
 		 393 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  32.69 
 
 		 394 aa  104  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  30.75 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  31.89 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  31.68 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  30.69 
 
 		 394 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  30.69 
 
 		 394 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  28.37 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  28.37 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.32 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  39.52 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  31.83 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  28.21 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  37.84 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  21.17 
 
 		 702 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  21.17 
 
 		 702 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  32.94 
 
 		 319 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.69 
 
 		 560 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 565 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  33.75 
 
 		 613 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  26.04 
 
 		 304 aa  49.7  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  23.08 
 
 		 295 aa  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  39.01 
 
 		 528 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  31.45 
 
 		 708 aa  47.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  28.43 
 
 		 306 aa  47.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.36 
 
 		 576 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.18 
 
 		 927 aa  45.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  27.64 
 
 		 298 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  27.64 
 
 		 298 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  28.03 
 
 		 663 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  26.18 
 
 		 294 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  34.4 
 
 		 290 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  30.05 
 
 		 308 aa  44.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  29.7 
 
 		 293 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 		 578 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  37.31 
 
 		 322 aa  44.3  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  34.68 
 
 		 290 aa  43.9  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>