199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1126 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 560 aa  1087    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  57.09 
 
 		 564 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  56.46 
 
 		 565 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  46.57 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.91 
 
 		 559 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 		 649 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.89 
 
 		 551 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  35.12 
 
 		 607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  33.39 
 
 		 577 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 		 605 aa  173  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.32 
 
 		 544 aa  165  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.54 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  25.49 
 
 		 544 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.41 
 
 		 549 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.23 
 
 		 544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.23 
 
 		 544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.12 
 
 		 547 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  24.41 
 
 		 547 aa  151  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.19 
 
 		 549 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  30.54 
 
 		 546 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.04 
 
 		 528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  27.08 
 
 		 613 aa  126  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  28.19 
 
 		 663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  27.57 
 
 		 519 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.28 
 
 		 927 aa  107  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  37.35 
 
 		 588 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  27.9 
 
 		 576 aa  94.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.94 
 
 		 439 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  25.41 
 
 		 539 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  27.08 
 
 		 869 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  27.91 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  34.71 
 
 		 126 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  30.68 
 
 		 593 aa  77.4  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  31.82 
 
 		 188 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.13 
 
 		 173 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  35.07 
 
 		 208 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  40.77 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  40.77 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  31.32 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  35.29 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  32.9 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  40.77 
 
 		 174 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 210 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  35.88 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  29.45 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  35.88 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  27.59 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  38.85 
 
 		 172 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  30.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  30.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  30.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  30.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  30.83 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 118 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 244 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  30.11 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 590 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.63 
 
 		 208 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 184 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.09 
 
 		 210 aa  59.7  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  27.87 
 
 		 121 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  27.43 
 
 		 697 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  32.26 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.85 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  30.47 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  28.51 
 
 		 513 aa  57  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 124 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 126 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 126 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 126 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  31.82 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 265 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  27.42 
 
 		 116 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  32.61 
 
 		 172 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  42.57 
 
 		 284 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  29.25 
 
 		 125 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 124 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  32.22 
 
 		 305 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  31.69 
 
 		 621 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 122 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 226 aa  54.3  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 128 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  36.67 
 
 		 184 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 128 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.82 
 
 		 173 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  33.15 
 
 		 708 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  29.22 
 
 		 309 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>