166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3270 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 225 aa  420  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  41.33 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  37.79 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  43.05 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  48.21 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  43.06 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  42.07 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  47.83 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  36.49 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  45.92 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.18 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  39.44 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.36 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  47.92 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  41.8 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  40.95 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  44.66 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  41.94 
 
 		 578 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.94 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.17 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  46 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  34.45 
 
 		 547 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  31.5 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  41.05 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  31.5 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  35.93 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  37.59 
 
 		 869 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  47.5 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  32.28 
 
 		 549 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 593 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  37.93 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.64 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  36.62 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  39.34 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  36.62 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  40.82 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  32.69 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  37.8 
 
 		 130 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  30.71 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.71 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  32.98 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  39.53 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  40.37 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 560 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  31.09 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  41.3 
 
 		 605 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  38.66 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  30.25 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30.25 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  38.78 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.05 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  38.69 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  40.54 
 
 		 539 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  39.5 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.92 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 528 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  34.59 
 
 		 613 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  38.35 
 
 		 576 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  42.11 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 565 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 128 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 128 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 128 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  37.1 
 
 		 124 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  35.78 
 
 		 125 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  33.98 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  36.29 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  36.29 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  36.29 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  32.54 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  36.29 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  35.61 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  34.96 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  36.29 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  36.07 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  33.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  33.98 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  37.39 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  36.36 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 551 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  37.39 
 
 		 122 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  35.11 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  35.11 
 
 		 129 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>