187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4214 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  100 
 
 		 125 aa  249  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  51.2 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  47.2 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  46.09 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  51.49 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  51.49 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  51.49 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  50.5 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  45.97 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  45.16 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  47.83 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  47.83 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  47.83 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  49.57 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  38.05 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  45.97 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  50.65 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  40.16 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  42.74 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  37.72 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  44.25 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  41.18 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  40.91 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  39.17 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  38.54 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  36.08 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  35.54 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  38.66 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  36.29 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  39.6 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  37.63 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  36.56 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 590 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.13 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  35 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  32.77 
 
 		 173 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  33.62 
 
 		 576 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  36.08 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  36.08 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  36.08 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  34.75 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  34.75 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  35.85 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  34.75 
 
 		 174 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  35.16 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  39 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 564 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  35.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 565 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  33.33 
 
 		 539 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 613 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  36.79 
 
 		 519 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1603  copper resistance protein CopC  28.06 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 		 663 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.32 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1963  copper resistance protein, putative  41.33 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  30.58 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>