145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3473 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 122 aa  246  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  48.33 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  40.65 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  41.9 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  40.52 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  38.1 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 613 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  33.63 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  31.93 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  32.17 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  33.66 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  36.59 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  34.04 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  34.04 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.46 
 
 		 590 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  32.74 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  33.33 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  33.02 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  36.19 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  26.89 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  32.74 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  30.1 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  29.59 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  29.59 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  29.59 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  30.71 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.69 
 
 		 549 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.66 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  27.73 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  27.72 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  29.36 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  28.16 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.87 
 
 		 547 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  28.16 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  26.27 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  30.23 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  29.82 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.87 
 
 		 544 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  26.92 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  26.27 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.41 
 
 		 544 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  26.55 
 
 		 544 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  26.55 
 
 		 544 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  25.41 
 
 		 549 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.55 
 
 		 547 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  29.37 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>