152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3812 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  74.8 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  74.76 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  73.79 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  73.79 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  72.12 
 
 		 132 aa  153  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  62.2 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  71.17 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  67.96 
 
 		 128 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  71.17 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  60.5 
 
 		 126 aa  141  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  65.05 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  62.07 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  62.5 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  60.19 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  52.25 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  52.25 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  50.49 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  45.37 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  45.79 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  43.4 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  40.32 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  37.29 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  41.94 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  35.83 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  37.6 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.02 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  40.5 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  36.8 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  39.45 
 
 		 241 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.45 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  34.71 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  36.75 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  29.6 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  40.38 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  37.98 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 126 aa  57  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.96 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  37.1 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  39.05 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  39.05 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  37.84 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 560 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  31.2 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  34.11 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.36 
 
 		 576 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  37.38 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 593 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 		 272 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.17 
 
 		 613 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  35.48 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  35.48 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 210 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  35.88 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  35.88 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  35.88 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 		 528 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  30.63 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  34.78 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  30.19 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 564 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 565 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  39.05 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 590 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 559 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 869 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  33.04 
 
 		 519 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.89 
 
 		 549 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  40.23 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28.83 
 
 		 547 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  40.23 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>