166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0566 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  100 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  41.87 
 
 
225 aa  121  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.8 
 
 
197 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  47.62 
 
 
284 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  48.62 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  48.51 
 
 
233 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  48.11 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  46.94 
 
 
244 aa  88.6  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  45.9 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  44.64 
 
 
241 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  49.49 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  37.59 
 
 
869 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  45.38 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  35.82 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.61 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  39.47 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  44.14 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  32.86 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.93 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  36.36 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  45.83 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  39.02 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  40.52 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  38.36 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.48 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.88 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  39.34 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.61 
 
 
565 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.61 
 
 
564 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  35.33 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  37.4 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  38.84 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  40.37 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  35.59 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  40.16 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 
560 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  35.46 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  40.2 
 
 
607 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  43.14 
 
 
551 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 
528 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  36 
 
 
590 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 
559 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  36.45 
 
 
519 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  38.19 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  33.86 
 
 
549 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  38.79 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  34.13 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  33.86 
 
 
544 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  40.66 
 
 
605 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  41.24 
 
 
434 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  37.93 
 
 
593 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 
547 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  31.82 
 
 
544 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  31.82 
 
 
544 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.97 
 
 
576 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 
127 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  39.58 
 
 
139 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 
141 aa  62  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 
141 aa  62  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  39.58 
 
 
131 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  33.08 
 
 
549 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  39.53 
 
 
184 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  33.33 
 
 
547 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40.2 
 
 
588 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  33.33 
 
 
544 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 
126 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 
126 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 
128 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 
128 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 
128 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 
126 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  37.37 
 
 
146 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  38.3 
 
 
578 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  32.03 
 
 
547 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  35.4 
 
 
125 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  30.73 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.09 
 
 
613 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 
124 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 
546 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  39.77 
 
 
121 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 
424 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  35.59 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 
119 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  38 
 
 
144 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 
577 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
124 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  38.64 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  35.42 
 
 
126 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  35.42 
 
 
129 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  35.42 
 
 
129 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>