170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2347 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 122 aa  237  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  45.97 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  48.51 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  44.25 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  46.85 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  46.73 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  39.84 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  39.34 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  52 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  46.23 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  36.59 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  46.08 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  48.98 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  47.57 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  47.57 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  41.12 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  45 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  47 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  47 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  47 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  40.16 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  50.51 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  40.2 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  41.58 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  41.58 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  50.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  50.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  41.58 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  41.58 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  44.55 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  36.59 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  36.59 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  36.59 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  41.46 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  41.46 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  43.56 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  40.19 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  38.52 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  40.59 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  40.91 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  44.55 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  40.91 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  38.21 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  39.25 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 613 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  44.34 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  35.92 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  38.1 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  37.14 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  40.16 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 590 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 223 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  36.89 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  38.96 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  40.22 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 564 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 565 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  38.24 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  39.09 
 
 		 576 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0796  copper resistance protein, putative  48.54 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  37 
 
 		 519 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.91 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.91 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 528 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0994  putative copper resistance protein CopC  46.39 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00681058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1001  putative copper resistance protein CopC  46.39 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0951  putative copper resistance protein  46.39 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>