175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4398 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  44.74 
 
 
119 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  42.2 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  42.06 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  44 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  43.16 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  38.32 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  45.36 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  39.8 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  40.98 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  45.98 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  45.98 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  36.36 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 
564 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  39.8 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  38.66 
 
 
565 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  39.39 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31.97 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 
663 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 
174 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  34.38 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.59 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  30 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  31.37 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  35.2 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  34.92 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  34.92 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  34.92 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  34.92 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  34.92 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  40.45 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  33.88 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  33.88 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  34.92 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  34.13 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  34.29 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 
559 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  28.21 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 
229 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 
590 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  32.38 
 
 
424 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 
560 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  31.4 
 
 
207 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 
223 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 
613 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 
869 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  37.89 
 
 
182 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 
241 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.29 
 
 
197 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 
546 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  40.21 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.05 
 
 
233 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  34.02 
 
 
265 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  28.3 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  27.87 
 
 
544 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>